Para asegurar un alto grado de precisón en la selección de propuestas y dar seguimiento a los proyectos y copartes, el FNDH trabaja con consultores locales en sus países priorizados. Su principal tarea es desarrollar las capacidades de las organizaciones apoyadas, dar seguimiento a los proyectos, y asesorar sobre estrategias y solicitudes. Para la selección de proyectos, el FNDH también hace uso de redes internacionales, referencias de donantes similares, y organizaciones de derechos humanos nacionales e internacionales. Todos los consultores del FNDH son activistas de derechos humanos cualificados, con vasta experiencia en organizaciones de base en sus respectivos países. El FNDH tiene consultores en Pakistán, Sri Lanka, India, México, Indonesia y Tailandia.