El FNDH reconoce que los derechos humanos son universales, indivisibles e interdependientes. Por lo tanto, el FNDH se esfuerza en promover los derechos humanos a nivel internacional proporcionando apoyo a los defensores de los derechos humanos a nivel local.
Sin embargo, el FNDH ha desarrollado un conjunto de criterios para seleccionar los países prioritarios:
- La situación de los derechos humanos,
- Las oportunidades de mejorar los derechos humanos a través del cabildeo y el acceso a la justicia,
- La presencia de organizaciones competentes,
- La necesidad de acceder al tipo de apoyos que el FNDH ofrece,
- La recomendación de los miembros del patronato y los donantes.
El FNDH revisa y acepta solicitudes de proyectos que provienen de estos países prioritarios, o están dirigidos a los defensores de derechos humanos en situación de riesgo.
Los actuales países prioritarios son: